Το βιολογικό ελαιόλαδο είναι αυτό που παράγεται με συγκεκριμένες διαδικασίες απόλυτα φιλικές στο περιβάλλον και τον άνθρωπο, σύμφωνα με τους σαφείς και ρητούς κανονισμούς της Ευρωπαϊκής Ένωσης περί Βιολογικής Γεωργίας. Αυτό σημαίνει, κατ' αρχάς, ότι οι ελιές έχουν καλλιεργηθεί χωρίς χημικά συνθετικά λιπάσματα, φυτοπροστατευτικά προϊόντα και ζιζανιοκτόνα. Αντίθετα με την κοινή πεποίθηση, η απόφαση για το εαν ένα ελαιόλαδο πιστοποιηθεί ως βιολογικό ή όχι, ξεκινάει μεν από το τι θα συμβεί στο χωράφι, αλλά εξαρτάται επίσης από τους χειρισμούς στο ελαιοτριβείο και τελειώνει στη διαδικασία εμφιάλωσης.
Όσον αφορά το ρυθμιστικό πλαίσιο, η διαδικασία σε γενικές γραμμές είναι η εξής:
Ο παραγωγός χρειάζεται να βρει έναν φορέα πιστοποίησης και να συνάψει γραπτή σύμβαση. Οι Οργανισμοί Ελέγχου Προϊόντων Βιολογικής Γεωργίας είναι ιδιωτικές εταιρίες που όμως έχουν εγκριθεί από το κράτος. Οι εταιρίες αυτές πληρώνονται από τον παραγωγό και δουλειά τους είναι να ελέγχουν και να πιστοποιούν ότι όντως τηρούνται όλες οι προδιαγραφές βιολογικής καλλιέργειας. Αυτό το πετυχαίνουν μεταξύ άλλων κατόπιν προγραμματισμένων αλλά και αιφνίδιων επισκέψεων στον αγρό, όπου συλλέγουν διάφορα δείγματα εδάφους ή φυτικών ιστών. Αυτά τα δείγματα στέλνονται στο εργαστήριο προκειμένου η χημική ανάλυση να αποκαλύψει τυχόν ίχνη χημικών επεμβάσεων του παραγωγού.
Η αρμόδια κρατική αρχή επίβλεψης των εγκεκριμένων Οργανισμών Ελέγχου και Πιστοποίησης (ΟΕΠ) προϊόντων βιολογικής γεωργίας είναι ο ΕΛΓΟ ΔΗΜΗΤΡΑ.